60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2323 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  26.8 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
88 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
368 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.98 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  27.06 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3628  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0092  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 
249 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  26.8 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.03 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  33.68 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  30.88 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  34.04 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3838  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
175 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 
142 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  25 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
387 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30 
 
 
305 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  31.75 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1482  hypothetical protein  27.27 
 
 
263 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  31.75 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
337 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  30.16 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.76 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  28.99 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  35.14 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  25.25 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  28.17 
 
 
112 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
118 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 
134 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
115 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
107 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>