More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1437 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  100 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 
289 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  42.2 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  41.34 
 
 
301 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 
305 aa  225  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  37.5 
 
 
300 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 
306 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 
306 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
307 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
308 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
401 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 
303 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
337 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  33.45 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  30.6 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
400 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 
384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
385 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
385 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
404 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
404 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
307 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 
307 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  31.11 
 
 
378 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 
422 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.11 
 
 
378 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 
318 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 
385 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  32.48 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  32.03 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  32.48 
 
 
418 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  30.69 
 
 
389 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
418 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
354 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 
323 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
317 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 
306 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.11 
 
 
311 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.82 
 
 
306 aa  135  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.52 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  31.5 
 
 
414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  28.77 
 
 
314 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 
309 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 
299 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
312 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  29.54 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 
293 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 
395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.78 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 
396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
298 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.27 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  31.73 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.27 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
387 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  26.9 
 
 
299 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
387 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  30.14 
 
 
289 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 
307 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 
310 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 
291 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
390 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 
285 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 
314 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
285 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 
310 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  29.07 
 
 
296 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 
292 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 
308 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  29.86 
 
 
289 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.44 
 
 
313 aa  122  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 
295 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.21 
 
 
331 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  31.84 
 
 
409 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  30.69 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>