More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0403 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 424 aa  863    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  68.32 
 
 		 423 aa  617  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  65.09 
 
 		 421 aa  561  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.14 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  48.46 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  42.48 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  47.98 
 
 		 433 aa  368  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  44.58 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  44.42 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  44.42 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  47.72 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  44.52 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  47.44 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.03 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  45.39 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  45.45 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  45.5 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  47.47 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 427 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  44.79 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  45.26 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 		 444 aa  359  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  43.3 
 
 		 427 aa  358  9e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  44.02 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>