32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2896 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 148 aa  282  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  64.63 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  50.39 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  47.55 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  36.43 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  40.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.6 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  36.36 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  30.88 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  30.07 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  29.66 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.14 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  30.22 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  25.9 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  35.21 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  32.74 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  27.14 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02415  hypothetical protein  29.86 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  32.58 
 
 		 168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003383  putative tricarboxylic transport TctB  30.56 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.11 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  31.82 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  31.82 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>