59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1107 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  100 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  59.73 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  58.39 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  58.86 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  58.39 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  24.54 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  27.14 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  26.62 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  28.06 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  24 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  26.37 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  25.67 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 2142 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  25.11 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  26.32 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  23.19 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  28.46 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  25.64 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  26.09 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  29.46 
 
 		 380 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  27.94 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  27.63 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  26.71 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.69 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  23.16 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  28.92 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  29.1 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  32.14 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  26.47 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  25.74 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  27.94 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  25.85 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  27.59 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  29.36 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  27.21 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  25.69 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  26.35 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  25.85 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  26.47 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  26.47 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>