37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0878 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2847  hypothetical protein  31.47 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  32.48 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01123  hypothetical protein  27.14 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  30.08 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  27.63 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  28.47 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  26.21 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  26.76 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  25.83 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  31.37 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  25.79 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  25.64 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  30.22 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  24.16 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  32.73 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  26.56 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  26.8 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  25.53 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  27.78 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  22.01 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.92 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  26.43 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  25.53 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  25.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  25.34 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  30.91 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  25.53 
 
 		 174 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  25.53 
 
 		 174 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  24.11 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>