More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf132 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf132  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
401 aa  827    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl087  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
441 aa  315  6e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.29436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
441 aa  299  4e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0138  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
436 aa  267  2e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.408298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
466 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
466 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
466 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
466 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
465 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
472 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
455 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
466 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
493 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
462 aa  239  8e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
461 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
465 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1158  cysteinyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
447 aa  233  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
468 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
467 aa  230  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
479 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2176  cysteinyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
423 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
470 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
487 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
468 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
459 aa  229  7e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
474 aa  229  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
465 aa  229  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1992  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
419 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162619  normal  0.881095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
469 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
468 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
457 aa  227  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
468 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
462 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
499 aa  226  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
469 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2173  cysteinyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
470 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0883162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
484 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
470 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
493 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
484 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
480 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
474 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
501 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
466 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
500 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
480 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
459 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
498 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 
459 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
488 aa  219  7.999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
470 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
464 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
477 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
459 aa  217  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
458 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
478 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
486 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
457 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
462 aa  216  4e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
460 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
460 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
481 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
456 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>