51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01055 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.86 
 
 
238 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  41.27 
 
 
237 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  39.17 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  44.38 
 
 
240 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  43.82 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.89 
 
 
280 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.81 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  43.26 
 
 
235 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.11 
 
 
267 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.11 
 
 
244 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  41.11 
 
 
267 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  43.26 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  43.82 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  41.11 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.11 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.11 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  43.26 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  33.62 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  33.18 
 
 
263 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.48 
 
 
264 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.83 
 
 
267 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  33.03 
 
 
242 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  33.81 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  31.31 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.58 
 
 
244 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  32.87 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  35.42 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  35.6 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  39.62 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  32.64 
 
 
298 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  27 
 
 
348 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  29.77 
 
 
376 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  28.44 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00120  hypothetical protein  25.25 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  27.94 
 
 
320 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  30.85 
 
 
343 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  26.15 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  27.94 
 
 
320 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  27.86 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  27.32 
 
 
347 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.98 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  26.96 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  25.98 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  30.62 
 
 
361 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  24.37 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  28.1 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.1 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  29.19 
 
 
361 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  24.34 
 
 
314 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  23.12 
 
 
249 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>