39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5903 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  41.55 
 
 		 418 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  44.85 
 
 		 403 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  42.69 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  35.66 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  30.85 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  28.05 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  25.06 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  29.43 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  28.28 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  23.48 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  25.97 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  25.97 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  24.93 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  26.67 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  24.26 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  26.83 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  27.17 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  23.48 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  23.66 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  22.46 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  58.82 
 
 		 542 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  31.98 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  29.94 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  28.75 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  42 
 
 		 651 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  33.59 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  38.46 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 762 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  26.53 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  37.5 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  40 
 
 		 603 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  38.46 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  38.46 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  38.46 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  28.78 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>