205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3568 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3568  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6399  peptidase M19 renal dipeptidase  79.9 
 
 		 485 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  32.11 
 
 		 438 aa  99  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30 
 
 		 328 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.11 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.21 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  33.49 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  34.6 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.03 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.27 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 		 333 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  34.98 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  32.81 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  32.02 
 
 		 602 aa  78.2  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  25.32 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  26.64 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  31 
 
 		 388 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  29.81 
 
 		 397 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  32.42 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  33.97 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  33.5 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  25.58 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  31.92 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  27.49 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  27.98 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  24.53 
 
 		 320 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  24.6 
 
 		 399 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.58 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  29.44 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  29.25 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.23 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  30.14 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  31.63 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  31.46 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  29.37 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  27.56 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  31.92 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  34.17 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  24.46 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  24.06 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  28.89 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.86 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.56 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  30.36 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  29.17 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  23.87 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.83 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.27 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.06 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  34.72 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  25.53 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  25 
 
 		 310 aa  62  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  32.27 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  31.37 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  36.07 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  30.13 
 
 		 329 aa  61.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  23.42 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.22 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  27.12 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  28.19 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  31.54 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  28.21 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.5 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  29.67 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  27.56 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25.79 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  26.42 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  23.28 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  24.68 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  33.07 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  28.4 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.57 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  23.81 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  23.71 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  23.28 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  28.46 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  24.44 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  28.21 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  32.32 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  23.74 
 
 		 462 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  22.22 
 
 		 409 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  23.71 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  26.94 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  23.71 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  23.71 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  23.71 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  30.25 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  29.34 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  27.43 
 
 		 386 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 		 377 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  23.56 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.87 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  27.01 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  29.33 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  23.56 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.91 
 
 		 433 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  24.14 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>