30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3397 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  100 
 
 		 151 aa  299  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  71.72 
 
 		 159 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  50 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  48.09 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  48.33 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  40.16 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  46.32 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  37.7 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  37.7 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  34.68 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  32.81 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  29.08 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.8 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  31.93 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  34.21 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  34.21 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  30.4 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  34.21 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  34.21 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  32.54 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  33.98 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  33.98 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  22.31 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  31.58 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  27.2 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.14 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  29.19 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3509  GtrA family protein  35.71 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>