191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3213 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  71.67 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  69.77 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  71 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  71 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  51.01 
 
 		 311 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.97 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  46.44 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 		 384 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  33.92 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  30.36 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 401 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  33.21 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  29.93 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  29.64 
 
 		 401 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  30.71 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  32.74 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  29.51 
 
 		 405 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  29.17 
 
 		 406 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  29.17 
 
 		 406 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  30.36 
 
 		 403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  29.29 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 		 395 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  30.85 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.67 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  25.67 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  28.52 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.94 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.94 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.94 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.94 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.89 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.62 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.62 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.62 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  24.29 
 
 		 335 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  25.64 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.34 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  25.64 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  29.33 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  25.64 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.34 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 		 337 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 		 337 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  25.74 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  30.14 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  28.71 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  28.1 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  24.11 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  24.11 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.63 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  25.27 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.01 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  26.28 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  26.16 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  23.83 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  25.45 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  22.71 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  22.71 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  22.46 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.28 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  26.07 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  21.81 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  21.81 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  26.76 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>