43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2947 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2947  phasin  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  88.44 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  77.54 
 
 		 162 aa  220  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  77.54 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  76.09 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  76.09 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  53.28 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  53.38 
 
 		 210 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  46.72 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  51.33 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  52.59 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  52.59 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  52.14 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  45.38 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  48.25 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  46.49 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  46.49 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  51.82 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  48.62 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  38.46 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  42.24 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  43.36 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  43.75 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  41.07 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  48.18 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  45.19 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  39.25 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  41.51 
 
 		 184 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  44.68 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  34.68 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  33.61 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.37 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  31.2 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  30.25 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  26.19 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  29.58 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  28.81 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  23.14 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>