127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2869 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  51.14 
 
 
761 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
760 aa  1523    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  51.01 
 
 
761 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  84.34 
 
 
762 aa  1279    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  80.91 
 
 
777 aa  1175    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  37.36 
 
 
978 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  32.72 
 
 
775 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  34.4 
 
 
789 aa  425  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  36.35 
 
 
965 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 
759 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  36.74 
 
 
748 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  34.42 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  33.82 
 
 
780 aa  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  33.72 
 
 
787 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  33.38 
 
 
787 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  33.71 
 
 
781 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  35.13 
 
 
807 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  34.31 
 
 
794 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  36.84 
 
 
720 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  36.36 
 
 
763 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  31.9 
 
 
769 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  30.01 
 
 
778 aa  350  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  35.98 
 
 
776 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.22 
 
 
749 aa  348  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  29.18 
 
 
780 aa  331  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.19 
 
 
759 aa  324  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  33.61 
 
 
755 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  33.47 
 
 
755 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  33.47 
 
 
755 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  33.33 
 
 
755 aa  320  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
755 aa  320  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  33.75 
 
 
755 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  33.33 
 
 
755 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  33.47 
 
 
755 aa  319  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  34.31 
 
 
704 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  38.79 
 
 
757 aa  318  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  31.85 
 
 
790 aa  318  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  32.12 
 
 
825 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  31.97 
 
 
795 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  31.59 
 
 
790 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  32.08 
 
 
858 aa  313  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.74 
 
 
1051 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  28.09 
 
 
781 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  31.58 
 
 
807 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 
1050 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  28.91 
 
 
748 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  31.55 
 
 
780 aa  300  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  33.95 
 
 
784 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.04 
 
 
787 aa  296  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  28.95 
 
 
778 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  32.97 
 
 
791 aa  293  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  30.16 
 
 
834 aa  292  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.55 
 
 
1052 aa  290  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  29.41 
 
 
753 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.22 
 
 
1053 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.48 
 
 
1051 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  31.06 
 
 
795 aa  287  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.32 
 
 
1055 aa  286  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  31.06 
 
 
795 aa  286  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  32.17 
 
 
843 aa  284  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  31.38 
 
 
791 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.31 
 
 
810 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 
804 aa  279  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.21 
 
 
1053 aa  280  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  30.31 
 
 
848 aa  278  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  30.28 
 
 
789 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  30.1 
 
 
805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  32.53 
 
 
789 aa  274  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  30.69 
 
 
788 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  31.28 
 
 
794 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.73 
 
 
794 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.58 
 
 
750 aa  272  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  30.93 
 
 
784 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.34 
 
 
786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.28 
 
 
777 aa  270  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  24.74 
 
 
768 aa  267  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  31.78 
 
 
786 aa  266  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  29.97 
 
 
800 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.01 
 
 
786 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  32.27 
 
 
824 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  26.36 
 
 
774 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.77 
 
 
1088 aa  265  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  24.44 
 
 
767 aa  264  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  30.72 
 
 
790 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  25.5 
 
 
780 aa  261  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  25.95 
 
 
710 aa  258  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
787 aa  258  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  31.51 
 
 
787 aa  258  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  31.51 
 
 
787 aa  258  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
1186 aa  257  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.2 
 
 
788 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  33.64 
 
 
807 aa  251  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  34.73 
 
 
986 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  27.73 
 
 
752 aa  250  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.64 
 
 
778 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.55 
 
 
752 aa  248  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  35.56 
 
 
767 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  30.98 
 
 
904 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  30.23 
 
 
1327 aa  243  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  30.06 
 
 
1215 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>