56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2511 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  97.17 
 
 
106 aa  206  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  97.17 
 
 
106 aa  203  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  90 
 
 
442 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  85.56 
 
 
554 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  60 
 
 
559 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  56.67 
 
 
559 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  50 
 
 
569 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  50 
 
 
551 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  50 
 
 
551 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 
553 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 
553 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 
553 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 
553 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 
553 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  50.52 
 
 
558 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  50.52 
 
 
558 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  48.91 
 
 
566 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  48.91 
 
 
566 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  48.91 
 
 
566 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  48.35 
 
 
594 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  48.35 
 
 
559 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  55.81 
 
 
352 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  48.19 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  50 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  50 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  50 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  50 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  50 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  48.35 
 
 
511 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  45.36 
 
 
360 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  44.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  55 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  48.39 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  48.39 
 
 
406 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  48.39 
 
 
522 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  48.39 
 
 
272 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  46.43 
 
 
680 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
515 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
515 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
515 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
515 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  37.29 
 
 
515 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>