100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1476 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  100 
 
 		 172 aa  340  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  80.65 
 
 		 153 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  42.04 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  44.59 
 
 		 356 aa  97.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  44.59 
 
 		 356 aa  97.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  44.59 
 
 		 356 aa  97.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  40.76 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  43.31 
 
 		 356 aa  95.5  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  43.12 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.67 
 
 		 353 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.67 
 
 		 353 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  36.42 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  36.24 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  38.16 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  35.82 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  27.4 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  27.4 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  27.4 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  27.4 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  27.4 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  30.25 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  30.25 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  26.71 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  27.86 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  28.47 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  27.41 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  28.77 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  29.45 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  29.45 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  29.11 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  26.32 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  26.32 
 
 		 356 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  28 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3501  hypothetical protein  67.27 
 
 		 96 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 355 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 355 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 355 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  26.09 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.18 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  34.43 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  29.81 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  22.73 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 597 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  31.07 
 
 		 193 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  31.07 
 
 		 193 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  31.07 
 
 		 193 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  29.45 
 
 		 342 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>