19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3231 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  814    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  40.43 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  40.53 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  40.26 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  39.2 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  40.05 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  33.42 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  30.4 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  20.9 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.73 
 
 		 510 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  22.3 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  24.45 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1919  hypothetical protein  23.92 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0683862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  22.14 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>