53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2338 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  59.09 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  44.05 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  46.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  41.57 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  51.92 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  63.16 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  71.43 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  44.05 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  41.94 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  73.33 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  37.89 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  60.53 
 
 		 497 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  46.15 
 
 		 209 aa  51.2  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  64.52 
 
 		 231 aa  51.2  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1844  hypothetical protein  52.63 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000118291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  46.15 
 
 		 462 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  45.28 
 
 		 266 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  36.73 
 
 		 259 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  35.25 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  41.51 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  62.5 
 
 		 285 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1132  hypothetical protein  45.07 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566375  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  61.54 
 
 		 203 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  47.5 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  54.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  44.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  51.06 
 
 		 433 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  55.56 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  61.54 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  65.38 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  67.74 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  37.1 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2396  hypothetical protein  41.54 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000890188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  57.58 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  64.29 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0471  hypothetical protein  47.83 
 
 		 241 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2397  hypothetical protein  37.1 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000007208  normal  1 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  66.67 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  64.29 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1598  hypothetical protein  63.33 
 
 		 263 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  unclonable  0.000000204973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  44.44 
 
 		 288 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  56.25 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1964  hypothetical protein  38.98 
 
 		 180 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.939203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  66.67 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1059  hypothetical protein  45.16 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.548994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2398  hypothetical protein  39.58 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  60 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>