29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2232 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  100 
 
 		 1915 aa  3802    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5440  hypothetical protein  46.84 
 
 		 582 aa  199  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  36.29 
 
 		 934 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  29.59 
 
 		 1135 aa  139  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  32.97 
 
 		 2400 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1830 aa  129  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  30.06 
 
 		 1093 aa  125  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  29.75 
 
 		 1093 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1221 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1221 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  25 
 
 		 1153 aa  94.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  27.26 
 
 		 771 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1253 aa  76.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  26.85 
 
 		 849 aa  73.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  24.07 
 
 		 1564 aa  72.4  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  24.49 
 
 		 694 aa  71.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  23.26 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  25.47 
 
 		 680 aa  61.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  25.47 
 
 		 680 aa  61.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  26.1 
 
 		 885 aa  57.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  26.37 
 
 		 885 aa  58.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  25.74 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  24.69 
 
 		 1059 aa  50.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  22.63 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1100 aa  48.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  25 
 
 		 2007 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  24.44 
 
 		 1816 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  24.44 
 
 		 1341 aa  47.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1157 aa  46.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>