228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1901 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  100 
 
 
214 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  68.42 
 
 
216 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  70.17 
 
 
215 aa  258  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  70.17 
 
 
215 aa  258  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  66.5 
 
 
214 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  71.26 
 
 
205 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  67.96 
 
 
221 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  68.39 
 
 
185 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  67.24 
 
 
182 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  70 
 
 
202 aa  238  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  67.44 
 
 
178 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  61.05 
 
 
202 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  62.86 
 
 
205 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  52.36 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  56.16 
 
 
224 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  59.66 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  59.77 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  56.32 
 
 
201 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  54.26 
 
 
214 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  58.76 
 
 
232 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  59.77 
 
 
226 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  59.77 
 
 
232 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  59.77 
 
 
226 aa  204  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  59.77 
 
 
210 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  59.77 
 
 
210 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  59.77 
 
 
226 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  59.77 
 
 
226 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  57.38 
 
 
184 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  56.83 
 
 
201 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  56.83 
 
 
225 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  54.84 
 
 
224 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  54.64 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  54.64 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  54.64 
 
 
222 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  50.52 
 
 
208 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  52.48 
 
 
201 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  52.48 
 
 
201 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  51.96 
 
 
213 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  48.45 
 
 
201 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  47.31 
 
 
219 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  47.21 
 
 
212 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  51.72 
 
 
201 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  49.74 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  49.43 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  46.56 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  49.18 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  48.69 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  50.77 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  48.69 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  47.7 
 
 
205 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  49.21 
 
 
201 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  51.91 
 
 
200 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  46.15 
 
 
228 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  43.78 
 
 
217 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  47.54 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  47.75 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  47.5 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  44.51 
 
 
209 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  47.19 
 
 
198 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  48.11 
 
 
217 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  45.99 
 
 
202 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  45.6 
 
 
219 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  46.07 
 
 
255 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  43.72 
 
 
200 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  47.37 
 
 
226 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  41.12 
 
 
206 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  45.93 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  43.18 
 
 
202 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  41.27 
 
 
200 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  40.31 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  40.31 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  41.53 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  40.31 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  43.32 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  41.48 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  45.05 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  41.01 
 
 
199 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  41.57 
 
 
185 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02304  lipase/acylhydrolase, GDSL family protein  44.91 
 
 
218 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  40.51 
 
 
216 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  43.65 
 
 
188 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  43.11 
 
 
199 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  42.29 
 
 
185 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  40.41 
 
 
227 aa  141  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  40.74 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  43.82 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.35 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2308  GDSL family lipase/acylhydrolase  37.3 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  43.11 
 
 
212 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.35 
 
 
197 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  39.77 
 
 
209 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.62 
 
 
216 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.62 
 
 
190 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.62 
 
 
211 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  38.86 
 
 
190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  42.37 
 
 
198 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  40.3 
 
 
222 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  42.16 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  42.16 
 
 
208 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  41.86 
 
 
182 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>