More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1809 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  53.13 
 
 
722 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1809  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  100 
 
 
705 aa  1419    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000172721  hitchhiker  0.000000000383819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.64 
 
 
748 aa  628  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  47.57 
 
 
734 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  48.9 
 
 
676 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  50.53 
 
 
725 aa  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  52.69 
 
 
712 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  50 
 
 
752 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  51.24 
 
 
826 aa  599  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.45 
 
 
684 aa  597  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  51.96 
 
 
792 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  51.31 
 
 
792 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  49.84 
 
 
837 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  50.89 
 
 
753 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  52.15 
 
 
789 aa  592  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  51.16 
 
 
841 aa  592  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.05 
 
 
720 aa  587  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.55 
 
 
726 aa  587  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  46.57 
 
 
861 aa  584  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  49.59 
 
 
812 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  46.05 
 
 
745 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  48.3 
 
 
823 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  48.13 
 
 
816 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  46.41 
 
 
834 aa  568  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0150  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.73 
 
 
716 aa  571  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1578  ATP-dependent proteinase ATP-binding subunit  46.65 
 
 
699 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  46.62 
 
 
817 aa  567  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  47.69 
 
 
853 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  44.35 
 
 
819 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.86 
 
 
862 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  47.34 
 
 
847 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  45.51 
 
 
848 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  48.72 
 
 
812 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  44.99 
 
 
848 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  46.96 
 
 
818 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2571  ATPase  43.61 
 
 
701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  47.62 
 
 
830 aa  565  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  46.96 
 
 
818 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  48.62 
 
 
894 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  48.68 
 
 
812 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2966  ATPase AAA-2 domain protein  47.59 
 
 
842 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  49.84 
 
 
886 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1608  ATPase AAA-2 domain protein  46.71 
 
 
994 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000771621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2624  ATPase  43.61 
 
 
701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  46.22 
 
 
855 aa  561  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1303  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  44.4 
 
 
702 aa  559  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0310613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  50.58 
 
 
791 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  46.14 
 
 
829 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  45.81 
 
 
812 aa  559  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  44.1 
 
 
830 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  45.96 
 
 
814 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  47.64 
 
 
848 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  45.11 
 
 
826 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  48.24 
 
 
812 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  46.04 
 
 
830 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.08 
 
 
812 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.21 
 
 
862 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  47.2 
 
 
825 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  46.72 
 
 
860 aa  555  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  47.98 
 
 
857 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  46.18 
 
 
840 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.44 
 
 
825 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  47.34 
 
 
810 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  50.25 
 
 
791 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  47.42 
 
 
818 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  47.16 
 
 
812 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  47.3 
 
 
815 aa  555  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5019  ATPase AAA-2 domain protein  47.71 
 
 
846 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0473703  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.21 
 
 
834 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  48.63 
 
 
813 aa  552  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.06 
 
 
846 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  43.94 
 
 
868 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  48.29 
 
 
825 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.64 
 
 
838 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  46.38 
 
 
864 aa  555  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  47.34 
 
 
843 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  48.7 
 
 
826 aa  549  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  46.32 
 
 
873 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  46.35 
 
 
814 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  45.21 
 
 
862 aa  552  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  45.15 
 
 
825 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  48.45 
 
 
869 aa  551  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  46.17 
 
 
861 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  46.88 
 
 
842 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  41.6 
 
 
863 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  48.87 
 
 
822 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.12 
 
 
835 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.58 
 
 
868 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.26 
 
 
862 aa  547  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 
810 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.56 
 
 
851 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  45.02 
 
 
874 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  48.95 
 
 
818 aa  547  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  46.11 
 
 
811 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  45.2 
 
 
839 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  45.25 
 
 
854 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  44.28 
 
 
866 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  47.15 
 
 
837 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  46.47 
 
 
824 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  44.93 
 
 
829 aa  546  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>