More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1721 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1721  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0049176  normal  0.88326 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1187  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  45.5 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  42.18 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0217  ABC transporter related  40.83 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000121534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  33.33 
 
 		 247 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  32.31 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0804  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.44 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.321319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  29.55 
 
 		 288 aa  128  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  33.33 
 
 		 252 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 259 aa  128  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  34.01 
 
 		 259 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  33.81 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  31.4 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.68 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  31.88 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  31.88 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  31.88 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  30.43 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  32.43 
 
 		 262 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  27.44 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  29.82 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  29.06 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  33.67 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  31.11 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  29.36 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  30.92 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  32.97 
 
 		 261 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  28.3 
 
 		 258 aa  118  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.33 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.33 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  26.46 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  32.9 
 
 		 320 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  30.92 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.79 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  30.1 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  28.79 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  30.1 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  29.05 
 
 		 250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  30.84 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  33.16 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  27.43 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  32.9 
 
 		 320 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  33.16 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  33.16 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  28.21 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  27.91 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  28.71 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  31.35 
 
 		 257 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  34.44 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 262 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  30.43 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  30.43 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  31.05 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  31.35 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  30.43 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  27.95 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  30.36 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0284  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  33.33 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  27.36 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  31.9 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  31.19 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  32.43 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  27.91 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  36.41 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  29.82 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  31.52 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  32.96 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  31.82 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  29.85 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  29.47 
 
 		 251 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  33.19 
 
 		 303 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  29.95 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  29.95 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>