26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1648 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  100 
 
 		 180 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  26.84 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  26.84 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  28.35 
 
 		 285 aa  80.9  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  27.81 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  77.4  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  28.1 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  25.82 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  21.93 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  22.11 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  20.63 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  29.19 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  28.87 
 
 		 278 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 583 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  27.21 
 
 		 274 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  20.86 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  23.68 
 
 		 321 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  22.89 
 
 		 274 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  25.81 
 
 		 279 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 275 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  25 
 
 		 277 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  28.57 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  28.3 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  24.17 
 
 		 280 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  27.13 
 
 		 289 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  22.05 
 
 		 350 aa  40.8  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>