More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0327 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  34.42 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  38.1 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
234 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
234 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  35.82 
 
 
216 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
234 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
234 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
234 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
234 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  34.86 
 
 
236 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  37.43 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  35.89 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  34.76 
 
 
224 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  38.29 
 
 
260 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
265 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 
235 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  32.6 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.98 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
186 aa  72  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  30.81 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  31.88 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  29.56 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  28.51 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  28.44 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.09 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  28.64 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  26.42 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  27.51 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  27.45 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  27.55 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  27.55 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  27.55 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.87 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.87 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  29 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  28.5 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.92 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  28.5 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  28.5 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  28.5 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  29.65 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  30.92 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  25.47 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  28.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  29.65 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>