More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1152 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  52.74 
 
 
278 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53 
 
 
236 aa  226  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.71 
 
 
270 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.27 
 
 
268 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  48 
 
 
267 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.54 
 
 
270 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.54 
 
 
270 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.46 
 
 
270 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.24 
 
 
274 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
270 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.22 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.75 
 
 
274 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.14 
 
 
266 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  47.19 
 
 
255 aa  215  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.75 
 
 
266 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.24 
 
 
256 aa  214  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  48.78 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
284 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  49.75 
 
 
312 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  51.21 
 
 
333 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  50 
 
 
279 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  50 
 
 
279 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  48.26 
 
 
251 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.25 
 
 
271 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  49.26 
 
 
290 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.25 
 
 
271 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.27 
 
 
266 aa  207  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.75 
 
 
271 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  50.24 
 
 
270 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.74 
 
 
255 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 
288 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.74 
 
 
255 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.26 
 
 
266 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  48.77 
 
 
330 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.75 
 
 
269 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  42.62 
 
 
275 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  48.02 
 
 
326 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 
261 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  47.78 
 
 
291 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 
272 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.09 
 
 
319 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  44.26 
 
 
263 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  47.09 
 
 
319 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  47.09 
 
 
319 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  47.09 
 
 
319 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  47.09 
 
 
319 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  47.12 
 
 
318 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  47.6 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  47.8 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  47.62 
 
 
275 aa  198  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  48.54 
 
 
262 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.76 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  47.12 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  46.8 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
273 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
327 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  50 
 
 
280 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  46.86 
 
 
277 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
376 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  41.53 
 
 
253 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  45.71 
 
 
278 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
376 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
376 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
376 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  45.59 
 
 
254 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  46.83 
 
 
283 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 
245 aa  188  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  45.89 
 
 
275 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.44 
 
 
353 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.86 
 
 
353 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  45.5 
 
 
241 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
330 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
376 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2845  ABC transporter related  50.74 
 
 
262 aa  185  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000305436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
376 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.67 
 
 
245 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.69 
 
 
271 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  40.76 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  44.55 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.44 
 
 
255 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  42.56 
 
 
353 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  40.98 
 
 
259 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>