More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  100 
 
 
347 aa  711    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0606  glutathione synthetase  52.59 
 
 
348 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000326698  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  51.72 
 
 
348 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  50.86 
 
 
347 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  45.98 
 
 
348 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  33.24 
 
 
323 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  33.55 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  33.23 
 
 
314 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1597  glutathione synthetase  27.89 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.890547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  32.91 
 
 
314 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  31.93 
 
 
311 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  31.95 
 
 
338 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  28.19 
 
 
324 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  32.36 
 
 
315 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  30.09 
 
 
317 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  34.12 
 
 
318 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  33.33 
 
 
316 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  32.8 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  31.79 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  35.34 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  31.14 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  32.8 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  32.94 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  30.14 
 
 
334 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  34.72 
 
 
317 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  32.31 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  32.81 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  32.81 
 
 
317 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  32.81 
 
 
317 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  36.54 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  33.2 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  31.31 
 
 
309 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  33.2 
 
 
315 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  33.43 
 
 
320 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  33.2 
 
 
315 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  30.72 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  33.2 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  31.65 
 
 
316 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  33.13 
 
 
320 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  33.2 
 
 
317 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  29.86 
 
 
334 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  29.3 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  29.3 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  29.3 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  29.3 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  36.29 
 
 
320 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  34.38 
 
 
319 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  31.33 
 
 
314 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  32.95 
 
 
316 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  28.96 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  34.38 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  35.74 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  35.61 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  31.77 
 
 
319 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  32.8 
 
 
315 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  33.98 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  33.2 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  33.98 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  30.15 
 
 
321 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  28.98 
 
 
315 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  33.98 
 
 
321 aa  135  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  36.86 
 
 
340 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  30.31 
 
 
320 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  30.72 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  30.72 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  33.86 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  36.68 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2899  glutathione synthetase  31.23 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000207563  normal  0.923755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  31.27 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  32.35 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  30.87 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  33.05 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  32.62 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  34.14 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  29.97 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  32.4 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  33.59 
 
 
329 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  31.76 
 
 
328 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  31.27 
 
 
319 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  36.36 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  32.28 
 
 
315 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  30.35 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  31.37 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0914  glutathione synthetase  30.89 
 
 
345 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0474988  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  31.23 
 
 
317 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  34.63 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  35.71 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  34.6 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  34.77 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  33.99 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  28.4 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  30.67 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  35.55 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  29.14 
 
 
316 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>