More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3866 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
324 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  69.62 
 
 
309 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  68.94 
 
 
298 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  68.58 
 
 
306 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  69.28 
 
 
327 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  67.81 
 
 
305 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  65.48 
 
 
364 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  68.62 
 
 
298 aa  408  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  65.15 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  70.79 
 
 
311 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  70.34 
 
 
305 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
336 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
311 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
311 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
314 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
299 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.86 
 
 
317 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
319 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
394 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
420 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
318 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
304 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
312 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
273 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  24.4 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
230 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
314 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 
324 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
298 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
316 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
358 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
315 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  28.71 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
393 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
344 aa  85.9  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.62 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  28.21 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  25.08 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  25.39 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  26.46 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>