153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2329 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 
383 aa  765    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  60.92 
 
 
379 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  47.84 
 
 
365 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  49.52 
 
 
366 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  48.73 
 
 
377 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  47.63 
 
 
360 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  48.4 
 
 
431 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  51.12 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  48.79 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  49.69 
 
 
373 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  31.05 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  30.77 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  29.9 
 
 
367 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  30.72 
 
 
367 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  30.72 
 
 
367 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  30.72 
 
 
367 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  31 
 
 
367 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  30.39 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  30.39 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  29.97 
 
 
367 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  33.55 
 
 
358 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  33.53 
 
 
374 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  36.09 
 
 
420 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  31.38 
 
 
411 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  36.26 
 
 
351 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  34.78 
 
 
536 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  34.62 
 
 
349 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  33.93 
 
 
340 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  28.52 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.88 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  35.36 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.61 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  36.93 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  38.18 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  38.64 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  33.21 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  37.17 
 
 
342 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.7 
 
 
418 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.77 
 
 
356 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.77 
 
 
392 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  33.89 
 
 
1020 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  28.95 
 
 
387 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  35.27 
 
 
466 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.74 
 
 
331 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.21 
 
 
429 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.57 
 
 
396 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.77 
 
 
588 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.82 
 
 
411 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.54 
 
 
464 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  31.58 
 
 
397 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.29 
 
 
474 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.4 
 
 
360 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  30.59 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  37.11 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  30.17 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  28.27 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  34.5 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.8 
 
 
483 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.6 
 
 
397 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  27.1 
 
 
379 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.4 
 
 
325 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  35.21 
 
 
370 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.39 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  29.12 
 
 
672 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  27.95 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  31.72 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.84 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  29.85 
 
 
712 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  39.89 
 
 
370 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  32 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.37 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  30.51 
 
 
1584 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  31.53 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  29.08 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  25.45 
 
 
411 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  24.73 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  31.21 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.65 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  25.09 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.6 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  25.81 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.37 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.43 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  30.67 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.23 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  33.66 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.51 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  29.13 
 
 
1299 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  29.13 
 
 
851 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.95 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  28.64 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  29.29 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  30.05 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.54 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  28.36 
 
 
710 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  29.51 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  32.9 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  29.91 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.84 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>