66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1316 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  100 
 
 
302 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  55.4 
 
 
285 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  55.97 
 
 
275 aa  298  9e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  58.78 
 
 
278 aa  297  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  57.72 
 
 
279 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  57.99 
 
 
281 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  55.89 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  58.43 
 
 
272 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  56.67 
 
 
290 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  54.17 
 
 
264 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  54.55 
 
 
269 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  53.68 
 
 
278 aa  279  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  57.25 
 
 
292 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  56.15 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  51.42 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  54.83 
 
 
680 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  52.59 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  55.76 
 
 
272 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  55.76 
 
 
272 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  55.76 
 
 
272 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  52.94 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  51.88 
 
 
269 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  52.99 
 
 
276 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  53.36 
 
 
270 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  52.54 
 
 
318 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  52.46 
 
 
279 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  51.64 
 
 
277 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  52.3 
 
 
356 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  42.05 
 
 
268 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.3 
 
 
705 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  41.52 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  35.93 
 
 
703 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  34.78 
 
 
275 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  34.78 
 
 
275 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  35.93 
 
 
703 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.79 
 
 
705 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.79 
 
 
705 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.93 
 
 
704 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  35.4 
 
 
294 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  32.96 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  34.55 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  35.23 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  23.7 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  25 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  27.17 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  25.18 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  28.23 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  29.03 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  25.1 
 
 
261 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  20.86 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  27.53 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  21.81 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  33.6 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  27.6 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  22.22 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  25.1 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  24.47 
 
 
254 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  24.47 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  24.89 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  27.49 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  22.69 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  30.4 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  27.13 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.62 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  30.85 
 
 
403 aa  42.4  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>