80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1389 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  45.31 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.31 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  40.2 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1733  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.75 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0581685  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  37.92 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  38.79 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.67 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  37.91 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.03 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  39.23 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  39.9 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  40.12 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  37 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  41.24 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  38.73 
 
 		 229 aa  89  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  41.52 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  37.31 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  37.31 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  37.31 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  37.37 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  38.86 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  37.93 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.19 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  37.95 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13790  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  38.22 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 419 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.84 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1898  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.92 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.81 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  31.36 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1884  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.77 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2558  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.4121  normal  0.303057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.52 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1360  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  30.21 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.63655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00173437  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0498  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.1 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.33 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3461  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.77 
 
 		 401 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  27.92 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.9 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.44 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.14 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.26 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.16 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2639  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.46 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.143151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  29.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  23.7 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.32 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0385  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.01 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.216591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  29.33 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.34 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.27 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  28.41 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1457  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.28 
 
 		 396 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00560715  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1260  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.05 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559672  hitchhiker  0.00689196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0753  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.91 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.986595 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  23.03 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0024  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  26.89 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.17 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0665302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1559  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.11 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.855984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1230  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.49 
 
 		 360 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5019  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  26.34 
 
 		 376 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4551  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 215 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1079  bifunctional deaminase-reductase-like  37.04 
 
 		 364 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>