19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0024 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0024  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1360  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  48.54 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.63655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2131  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  45.25 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1870  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.93 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.02 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  28.86 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.9 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.44 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  30.24 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  27.62 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  25.53 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  29.31 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  28.44 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.89 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  21.4 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>