33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4146 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  42.27 
 
 
537 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  40.41 
 
 
569 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  40.59 
 
 
568 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  29.82 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.95 
 
 
1164 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  29.53 
 
 
494 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25.91 
 
 
615 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.69 
 
 
620 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.44 
 
 
564 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.13 
 
 
632 aa  52.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  27.78 
 
 
741 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.4 
 
 
674 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  27.81 
 
 
601 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.95 
 
 
614 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.93 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  28.92 
 
 
503 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.26 
 
 
569 aa  45.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.52 
 
 
585 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  34.58 
 
 
610 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  26.7 
 
 
599 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  23.89 
 
 
445 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.66 
 
 
551 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.7 
 
 
585 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  30.65 
 
 
626 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.4 
 
 
546 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.2 
 
 
512 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.16 
 
 
1219 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.48 
 
 
569 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 
825 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.16 
 
 
1219 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.16 
 
 
1219 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  27.42 
 
 
976 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>