33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3560 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  31.4 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  30.58 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  35.77 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  38.66 
 
 
157 aa  58.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  34.33 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  35.61 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  30.83 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  32.85 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  38.52 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  35.56 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  32.61 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  35.56 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  29.2 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  35.66 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  34.35 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35.77 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  32.03 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  27.35 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  34.75 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.82 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  28.93 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  28.36 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  31.03 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  33.58 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  34.92 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  30.95 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  27.93 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>