47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2382 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2382  DinB  100 
 
 		 171 aa  353  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  47.27 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  49.68 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  46.2 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  35.5 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  36.65 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  36.36 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  38.79 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  39.38 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  37.33 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  33.55 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  35.62 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  36.16 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  37.58 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  30.91 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  30.49 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  37.16 
 
 		 171 aa  87.8  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  34.32 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  32.65 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  32.93 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  34.59 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  34.81 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  33.95 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  28.74 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  32.93 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  30.92 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  26.95 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  32.88 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  29.45 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  30.91 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  26.47 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  30.91 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  28.77 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  26.16 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  30.3 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  29.05 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  27.33 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  29.52 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  30.23 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  28.31 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  20.11 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  25.15 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3935  DinB family protein  24.18 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  43.48 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>