More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1356 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  90.32 
 
 		 121 aa  219  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  82.46 
 
 		 116 aa  189  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  78.26 
 
 		 555 aa  185  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  72.8 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  73.5 
 
 		 562 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  73.04 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  55.14 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  45.53 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  47.32 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  50.89 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  50 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.32 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  49.11 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.43 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>