45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0959 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  85.77 
 
 		 253 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  75.71 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  73.28 
 
 		 252 aa  378  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  45.56 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  37.34 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  36.4 
 
 		 231 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  27.73 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  26.89 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  27.73 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  26.89 
 
 		 230 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  28.45 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  25.2 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  23.11 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  25.66 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  22.36 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  24.58 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  22.78 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  24.79 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  23.28 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 498 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  24.89 
 
 		 484 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  24.35 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  39.44 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  40.32 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  38.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  37.5 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  22.73 
 
 		 496 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  39.13 
 
 		 467 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  24.78 
 
 		 532 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 470 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  25.7 
 
 		 505 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  26.25 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.63 
 
 		 498 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  38.81 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  40.32 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  22.43 
 
 		 496 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.07 
 
 		 451 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0068  signal transduction ATPase  26.61 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.580007  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 480 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  41.38 
 
 		 448 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 		 458 aa  42  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  23.08 
 
 		 481 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>