More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0452 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  50.95 
 
 		 214 aa  217  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  49.32 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  49.19 
 
 		 129 aa  138  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  47.9 
 
 		 129 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  52.1 
 
 		 130 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.97 
 
 		 415 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  52.94 
 
 		 129 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  49.58 
 
 		 129 aa  112  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 681 aa  107  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  40.34 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  35.21 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  39.02 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.04 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  42.86 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  44.29 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.62 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.62 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.62 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.62 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  34.07 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.03 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  41.25 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.67 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  38.57 
 
 		 99 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  38.57 
 
 		 99 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  38.57 
 
 		 99 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 99 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  36.76 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.62 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  37.97 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  38.57 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  38.57 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  34.29 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  34.29 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  41.43 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  41.43 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  35.8 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.14 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  38.57 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  36.49 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  37.14 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1619  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.33 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  33.77 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  41.43 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 358 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 		 369 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  31.91 
 
 		 121 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  35.8 
 
 		 99 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  34.78 
 
 		 346 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  34.78 
 
 		 346 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  39.71 
 
 		 351 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  37.14 
 
 		 99 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1242  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  32.47 
 
 		 366 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 122 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2459  heat shock protein DnaJ domain protein  44.07 
 
 		 314 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000295902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  48.15 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  35.29 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3822  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.77 
 
 		 356 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal  0.275552 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  40.98 
 
 		 123 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  40.54 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  35.82 
 
 		 99 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.82 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.78 
 
 		 369 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.86 
 
 		 358 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.86 
 
 		 358 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.86 
 
 		 358 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  40 
 
 		 122 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  35.37 
 
 		 358 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 94 aa  52.4  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.82 
 
 		 364 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.82 
 
 		 364 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.86 
 
 		 358 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 98 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.03 
 
 		 354 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  36 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.78 
 
 		 361 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  32.35 
 
 		 361 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  34.04 
 
 		 111 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 358 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 362 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.58 
 
 		 122 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  28.21 
 
 		 357 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  30.26 
 
 		 365 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.88 
 
 		 349 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.26 
 
 		 365 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 		 362 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.43 
 
 		 351 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  35.71 
 
 		 99 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  35.71 
 
 		 100 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.44 
 
 		 345 aa  51.6  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.88 
 
 		 362 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.23 
 
 		 341 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.13 
 
 		 329 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  38.98 
 
 		 121 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>