36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3397 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  33.47 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  36.18 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  32.52 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  36.31 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  36.87 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 164 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  34.62 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6247  hypothetical protein  43.85 
 
 		 131 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 198 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  30.18 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  30.69 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 187 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 151 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  33.12 
 
 		 169 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  26.42 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  27.19 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  31.41 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  32.05 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  32.05 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  28.11 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  27.23 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0767  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0747  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0753  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  26.34 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4358  hypothetical protein  26.51 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>