More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2537 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 574 aa  1165    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  69.71 
 
 		 579 aa  811    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  83.8 
 
 		 573 aa  999    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 590 aa  782    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 		 582 aa  822    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 555 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 634 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 574 aa  333  5e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 588 aa  333  7.000000000000001e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 570 aa  319  7e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 570 aa  319  7e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 570 aa  306  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 569 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 573 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 555 aa  189  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 556 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 799 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 816 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 556 aa  180  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 568 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 556 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 580 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 552 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 569 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 569 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 569 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 569 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 563 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 572 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 569 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 559 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 558 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 580 aa  173  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 576 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 570 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 556 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 564 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 555 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 567 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  27.53 
 
 		 858 aa  170  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 596 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 552 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 580 aa  170  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 555 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  27.04 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 569 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>