135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1466 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  47.85 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  31.28 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  31.17 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  29.88 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  33.61 
 
 
259 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  33.61 
 
 
259 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  0.0000000053706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  31.75 
 
 
257 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  29.88 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  33.86 
 
 
261 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  32.26 
 
 
269 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.08 
 
 
251 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  30.65 
 
 
269 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  26.75 
 
 
243 aa  105  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.66 
 
 
251 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  27.2 
 
 
260 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  29.18 
 
 
263 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  30.65 
 
 
272 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  30.47 
 
 
267 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  30.12 
 
 
266 aa  99  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  29.15 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  27.94 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  28.1 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  28.89 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  28.74 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  30.68 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  29.36 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  29.13 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  31.2 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  29.03 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  27.78 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  30.8 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  29.48 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  29.3 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  30.35 
 
 
267 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  30.35 
 
 
267 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  30.35 
 
 
267 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  31.17 
 
 
266 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  30.45 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  29 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  26.69 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  26.17 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.48 
 
 
253 aa  89  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  28.45 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  25.81 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  27.57 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  31.35 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  25.33 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  27.6 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  31.25 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  26.44 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  29.69 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  27.02 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  29.2 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  27.17 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  27.2 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  24.89 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  24.89 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  27.94 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  28.69 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  35.97 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  33.5 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  27.23 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  28.12 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  26.01 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  27.68 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  24.8 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  28.38 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  28.88 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  28.88 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  29.96 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  25.63 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  27.63 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  24.31 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>