52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6038 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  29.54 
 
 
349 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  30.65 
 
 
133 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  32.17 
 
 
469 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  29.03 
 
 
133 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  29.03 
 
 
133 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  31.11 
 
 
133 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  29.19 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  33.03 
 
 
132 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  45.28 
 
 
103 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  43.06 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  43.06 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  43.06 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  43.06 
 
 
139 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  37.21 
 
 
133 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  43.06 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  47.06 
 
 
135 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  32.41 
 
 
200 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  43.06 
 
 
124 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  43.06 
 
 
124 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  29.92 
 
 
125 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  45.28 
 
 
103 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  45.28 
 
 
103 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  30.58 
 
 
99 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  43.4 
 
 
99 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  34.07 
 
 
124 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  43.4 
 
 
99 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  31.96 
 
 
106 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  28.93 
 
 
132 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  31.36 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  27.83 
 
 
110 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  43.4 
 
 
112 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  31.62 
 
 
110 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  28.7 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  44.07 
 
 
129 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  41.51 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  41.51 
 
 
99 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  41.18 
 
 
124 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  41.18 
 
 
124 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  39.22 
 
 
123 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  25.62 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  39.22 
 
 
123 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  39.22 
 
 
123 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  41.51 
 
 
99 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  37.25 
 
 
124 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  40.38 
 
 
479 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  43.86 
 
 
125 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  39.22 
 
 
113 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0141  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>