28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5053 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  25.76 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  26.05 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  27 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  24.71 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  27.11 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  28.96 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.56 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.32 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  25.98 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  24.81 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  26.85 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  28.14 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  28.14 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  28.14 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.97 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  27.88 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  26.69 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  25 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  25.66 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  22.74 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25.13 
 
 		 780 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.04 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 1016 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.38 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  24.42 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  24.81 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>