More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4455 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
501 aa  1008    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  45.85 
 
 
301 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  45.51 
 
 
301 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  43.85 
 
 
297 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  43.85 
 
 
297 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  43.85 
 
 
297 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  43.85 
 
 
297 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  43.52 
 
 
297 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  43.85 
 
 
297 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  40.13 
 
 
310 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.85 
 
 
297 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  44.55 
 
 
302 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.19 
 
 
297 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  44.19 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.19 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  44.19 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  43.52 
 
 
297 aa  246  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  44.52 
 
 
295 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  41.72 
 
 
297 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  43.56 
 
 
301 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  43.85 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  42.52 
 
 
297 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  39.93 
 
 
297 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.61 
 
 
300 aa  233  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  39.07 
 
 
297 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  38.74 
 
 
297 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  42.19 
 
 
298 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  37.74 
 
 
309 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.74 
 
 
306 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  41.1 
 
 
307 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 
307 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 
307 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  39.22 
 
 
306 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  38.41 
 
 
297 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  36.77 
 
 
309 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  39.54 
 
 
306 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  41.69 
 
 
309 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.01 
 
 
307 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  41.53 
 
 
313 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  38.76 
 
 
307 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  37.7 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  41.97 
 
 
309 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  40.4 
 
 
296 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  41.39 
 
 
296 aa  220  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  41.06 
 
 
296 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  39.54 
 
 
301 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  41.06 
 
 
296 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  40.2 
 
 
304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  39.03 
 
 
307 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.41 
 
 
297 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  42.33 
 
 
309 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43 
 
 
321 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  41.12 
 
 
311 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  40.52 
 
 
298 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  39.41 
 
 
313 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  35.39 
 
 
310 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  36.72 
 
 
308 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  36.07 
 
 
308 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  38.31 
 
 
373 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  39.27 
 
 
464 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  39.02 
 
 
296 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  38.89 
 
 
312 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  40.73 
 
 
297 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 
313 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
301 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  36.39 
 
 
308 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  38.41 
 
 
302 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  35.91 
 
 
294 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.66 
 
 
313 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.4 
 
 
310 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  38.34 
 
 
309 aa  206  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  36.33 
 
 
293 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  38.24 
 
 
312 aa  206  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  36.45 
 
 
304 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  38.28 
 
 
300 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  41.86 
 
 
299 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  40.45 
 
 
314 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  37.67 
 
 
295 aa  204  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  38.44 
 
 
313 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  39.67 
 
 
499 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.94 
 
 
298 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.61 
 
 
298 aa  203  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  42.38 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  37.79 
 
 
300 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
299 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  38.87 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  38.87 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  38.87 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
304 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  35.22 
 
 
302 aa  193  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  41.72 
 
 
298 aa  193  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  36.72 
 
 
462 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  33.78 
 
 
300 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>