58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0845 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  100 
 
 
740 aa  1469    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  93.92 
 
 
740 aa  1385    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  33.49 
 
 
521 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  35.98 
 
 
401 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  30.64 
 
 
509 aa  160  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  30.64 
 
 
509 aa  160  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  33.6 
 
 
599 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  32.21 
 
 
522 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  31.77 
 
 
514 aa  158  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  30.28 
 
 
509 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  28.6 
 
 
514 aa  155  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  32.14 
 
 
518 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  30.95 
 
 
1117 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  30.84 
 
 
522 aa  147  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  32.83 
 
 
821 aa  146  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  29.67 
 
 
522 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  27.42 
 
 
512 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  29.52 
 
 
544 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  33 
 
 
660 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  31.78 
 
 
724 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  31.39 
 
 
522 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  29.38 
 
 
509 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  28.48 
 
 
551 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  27.11 
 
 
521 aa  134  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  27.61 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  28.74 
 
 
524 aa  130  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  30.56 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  32.53 
 
 
781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  33.22 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  33.96 
 
 
596 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  30.96 
 
 
542 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  29.51 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  32.04 
 
 
569 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  31.93 
 
 
644 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  27.65 
 
 
405 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  31.51 
 
 
690 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  31.42 
 
 
802 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  29.46 
 
 
585 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  33.95 
 
 
405 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  31.61 
 
 
465 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.58 
 
 
700 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  27.61 
 
 
402 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  28.9 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  28.18 
 
 
500 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  29.33 
 
 
649 aa  81.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  27.92 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  33.33 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  30.16 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  29.59 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  28.16 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  25.91 
 
 
686 aa  69.7  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  27.6 
 
 
517 aa  64.7  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  27.89 
 
 
734 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  26.29 
 
 
522 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  28.04 
 
 
479 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  29.1 
 
 
498 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  25 
 
 
499 aa  55.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  25 
 
 
499 aa  55.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>