71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3210 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  75.74 
 
 		 132 aa  194  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  74.81 
 
 		 133 aa  189  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  65.22 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  66.9 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  51.88 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.86 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.57 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.78 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.12 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  50.77 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  46.88 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  43.28 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  47.62 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  48.33 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  46.67 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  54.39 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  54.39 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  54.39 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  49.15 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  44.07 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.99 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  43.33 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  42.31 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  40.98 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  27.83 
 
 		 255 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  41.07 
 
 		 457 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.96 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.78 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.77 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.11 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  37.29 
 
 		 454 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.27 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  39.66 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 458 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 454 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 454 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 456 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  42.22 
 
 		 455 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  42.22 
 
 		 455 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2542  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.38 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  29.55 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.1 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  54.24 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  32.22 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.8 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  43.14 
 
 		 473 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  32.43 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  37.74 
 
 		 436 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  31.11 
 
 		 203 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  32.2 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1021  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  32.86 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.7 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3330  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  28.41 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  38.89 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1390  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.11 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  40.68 
 
 		 448 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>