232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2486 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  65.7 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  60.87 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  52.31 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  50.71 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  45.1 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  41.29 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  40.59 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  40.32 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  40.53 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  42.86 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  42.65 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  40 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  31.82 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  32.23 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  32.83 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  32.67 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  31.31 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  27.16 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  30.2 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  33.33 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  34.83 
 
 		 273 aa  91.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  33.87 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  34.07 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  31.22 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  32.79 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  32.84 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.03 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  36.92 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 295 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 293 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 293 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  36.92 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.78 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  21.28 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.78 
 
 		 294 aa  48.5  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.1 
 
 		 295 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  41.94 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.69 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  22.79 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  22.76 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.86 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  27.88 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  38.18 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  38.96 
 
 		 409 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 315 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  38.18 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 296 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  39.47 
 
 		 307 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  34.78 
 
 		 417 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  35.37 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  35.45 
 
 		 339 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.08 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  47.06 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.82 
 
 		 307 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  25.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  40.54 
 
 		 397 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000190936  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000753069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.59 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  29.37 
 
 		 297 aa  45.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  28.97 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.6 
 
 		 299 aa  44.7  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  31.01 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.8 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  40.54 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>