More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0625 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0625  GTP-binding protein  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222196  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1102  GTP-binding protein  77.56 
 
 
205 aa  346  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3560  small GTP-binding protein  76.59 
 
 
205 aa  338  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1574  small GTP-binding protein  70.24 
 
 
205 aa  322  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1378  GTP-binding protein  70.1 
 
 
206 aa  305  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1907  GTP-binding protein  49.49 
 
 
209 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0300  GTP-binding protein  45.18 
 
 
207 aa  193  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0823  GTP-binding protein  40.43 
 
 
190 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  37.95 
 
 
230 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0535  GTP-binding protein  39.66 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.981766  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1384  GTP-binding protein  39.66 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304581  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0303  GTP-binding protein  39.08 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0012  GTP-binding protein  40.3 
 
 
227 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4189  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.75 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0267614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.26 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.72 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3013  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.03 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3815  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.990986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3899  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00203743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.72 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0456  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.57 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  33.33 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.67 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2558  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.14 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2302  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.72 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000228777  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0275  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.68 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0595  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.91 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.232511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0553  GTP-binding protein  30.77 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3276  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.21 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1105  GTP-binding protein HSR1-related  30.32 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.322379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1596  small GTP-binding protein  31.54 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0406  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.08 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.86 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.34 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0245  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.17 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000051605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1800  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.05 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10280  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.8 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000284353  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2142  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.99 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2197  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.04 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0465  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.9 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0246  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  22.77 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0886847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0617  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.81 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0414  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.58 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0262  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.93 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0443  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.5 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.793464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1765  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.08 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2742  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.68 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.313609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  27.7 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1731  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.08 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.114036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0305  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.11 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4052  GTP-binding protein, HSR1-related  33.58 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1237  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.56 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0772533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.26 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3340  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.49 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0113  GTP-binding protein  27.74 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2391  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.66 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0346  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.83 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0636282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
471 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  33.8 
 
 
465 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0075  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.8 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611399  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1643  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.33 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00260781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1381  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.33 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.479238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  29.95 
 
 
438 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0579  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.95 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.161528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  33.1 
 
 
465 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  28.99 
 
 
645 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  30.46 
 
 
734 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1202  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.95 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0025495 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf693  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.46 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  33.1 
 
 
465 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  32.97 
 
 
454 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  30.48 
 
 
314 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13390  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0353  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.03 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0844949  normal  0.0598906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 
645 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3352  small GTP-binding protein  28.87 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0529081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0232  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.08 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0361  small GTP-binding protein  33.58 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  29.95 
 
 
458 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  30.92 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000626094  hitchhiker  0.0000000000000161313 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl357  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.66 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2032  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.39 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0524569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2171  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.17 
 
 
227 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  32.97 
 
 
454 aa  55.1  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  28.11 
 
 
453 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1423  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.08 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.192754  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  28.34 
 
 
778 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  29.56 
 
 
453 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
646 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0326  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.96 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0247  GTPase  33.09 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0652935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.35 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0360198  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  30.69 
 
 
438 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0003  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.88 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_4896  predicted protein  37.62 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.26 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5378  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.27 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0596  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.54 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.502995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>