More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3474 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3474  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1870  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  81.97 
 
 
310 aa  492  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.540792  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0992  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  70.61 
 
 
290 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.71 
 
 
266 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  35.29 
 
 
267 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.61 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.77 
 
 
265 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  33.21 
 
 
238 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.39 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.79 
 
 
250 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.14 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  33.09 
 
 
468 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.96 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.29 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  35.4 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  32.01 
 
 
777 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.63 
 
 
867 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.31 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.7 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.58 
 
 
472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  32.47 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.47 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.97 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.96 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.37 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.09 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  31 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  36.53 
 
 
238 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.92 
 
 
837 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.5 
 
 
240 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  31 
 
 
241 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  32.86 
 
 
423 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  32.73 
 
 
458 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  35.97 
 
 
772 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.5 
 
 
240 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  31 
 
 
241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.97 
 
 
596 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.07 
 
 
236 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  31 
 
 
241 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  35.61 
 
 
776 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.97 
 
 
520 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  35.14 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.35 
 
 
451 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  35.14 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.61 
 
 
469 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.94 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.57 
 
 
800 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  34.42 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  31.64 
 
 
663 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
778 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.93 
 
 
245 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  36.9 
 
 
797 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.37 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.8 
 
 
263 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.77 
 
 
594 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.23 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  32.29 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.79 
 
 
631 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  31.88 
 
 
567 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.64 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.13 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  32.49 
 
 
561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.55 
 
 
629 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.52 
 
 
623 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.4 
 
 
329 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.66 
 
 
577 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  33.46 
 
 
255 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.32 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.16 
 
 
567 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.44 
 
 
251 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.17 
 
 
623 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.3 
 
 
595 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.45 
 
 
572 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.29 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.24 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.5 
 
 
512 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  32.49 
 
 
537 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.32 
 
 
236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.54 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3282  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.98 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776129  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.68 
 
 
327 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.38 
 
 
254 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.8 
 
 
563 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.7 
 
 
331 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.02 
 
 
571 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.34 
 
 
560 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.24 
 
 
250 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.21 
 
 
254 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.88 
 
 
565 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  30.82 
 
 
581 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.94 
 
 
435 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  32.13 
 
 
326 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  29.02 
 
 
574 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.34 
 
 
560 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.88 
 
 
250 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.16 
 
 
250 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.38 
 
 
328 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  30.43 
 
 
564 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.07 
 
 
612 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  39.39 
 
 
526 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>