36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0879 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0879  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  477  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  47.74 
 
 
235 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.42 
 
 
248 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  47.7 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  44.49 
 
 
248 aa  184  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  38.08 
 
 
221 aa  128  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  31.49 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28.19 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  26.18 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.76 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  24.56 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  38.14 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  26.41 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  29.36 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  27.73 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  27.66 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  34.69 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.73 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  25.94 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  23.28 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  25.11 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  34.15 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
211 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  34.41 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  24.73 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.86 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  30.11 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  30.11 
 
 
226 aa  42  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>