More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5252 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  100 
 
 		 577 aa  1183    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  100 
 
 		 577 aa  1183    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3324  integrase catalytic region  42.29 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00187829  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5058  hypothetical protein  61.37 
 
 		 281 aa  345  8.999999999999999e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5221  hypothetical protein  61.37 
 
 		 281 aa  345  8.999999999999999e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5057  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 294 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.601105  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5220  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 294 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  29.14 
 
 		 208 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  39.08 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  29.14 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  29.14 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  29.14 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  27.07 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  29.86 
 
 		 172 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  27.38 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  36.78 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  36.78 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0662  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0691  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.428791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0068  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1486  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.000219526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0447  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0510  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.384785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0673  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0277  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.213887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  35.9 
 
 		 245 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  26.32 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1412  Integrase catalytic region  28.66 
 
 		 253 aa  56.2  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000825692  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  29.2 
 
 		 308 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  29.2 
 
 		 308 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  29.2 
 
 		 308 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 306 aa  53.9  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 258 aa  53.5  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  27.74 
 
 		 308 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  24.6 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  24.6 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  24.6 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  24.6 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 296 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  23.33 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  27.89 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  24.59 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 296 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 373 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 296 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  32.95 
 
 		 257 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>